Jakarta, SatukanIndonesia.com – Virus Sars-CoV-2 yang menyebabkan infeksi covid-19 pada manusia disebut mengganggu kemampuan sel untuk melawan infeksi atau melawan kekebalan tubuh manusia.
Para peneliti merinci bagaimana protein virus berinteraksi dengan RNA inang untuk mengganggu kemampuan sel untuk melawan infeksi. Protein virus yang dikodekan oleh SARS-CoV-2 mengganggu komponen kritis mesin molekuler sel manusia dan menonaktifkan respons terhadap infeksi, menurut sebuah penelitian yang diterbitkan 8 Oktober di Cell.
Mengutip The Scientist, para peneliti di AS menjelaskan bagaimana protein virus tertentu mengikat RNA manusia yang terlibat dalam penyambungan RNA, terjemahan protein, dan perdagangan protein, dan dengan demikian menekan koordinasi sel inang dari pertahanan antivirus utama yang dikenal sebagai respons interferon tipe I.
Dalam respons interferon tipe I, sebuah sel yang telah mendeteksi materi genetik asing di dalam sitoplasma menyebabkan produksi dan sekresi interferon – memberi sinyal pada protein yang selanjutnya memicu ekspresi ratusan gen antivirus.
Studi oleh Terrier dan lainnya telah melaporkan bahwa pasien dengan COVID-19 parah sering menunjukkan penurunan produksi interferon yang sangat besar, menunjukkan bahwa keberhasilan virus dalam beberapa kasus mungkin terkait dengan kemampuan untuk mengganggu pertahanan seluler ini.
Ahli biologi Caltech, Mitchell Guttman, bersama dengan Dev Majumdar dari Larner College of Medicine Universitas Vermont dan rekannya, menemukan bagaimana SARS-CoV-2 mungkin melakukan ini sambil mempelajari interaksi antara 27 protein yang diketahui virus dan RNA manusia secara in vitro.
Para peneliti telah memasukkan gen untuk setiap protein SARS-CoV-2 ke dalam set sel manusia yang berbeda, sehingga setiap sel hanya akan menghasilkan satu protein virus. Kemudian, tim mengekstraksi protein tersebut bersama dengan RNA apa pun yang mereka ikat dan mempelajari interaksi antara molekul.
Para peneliti menemukan bahwa 10 protein virus terikat pada RNA yang terlibat dalam proses sel penting seperti penyambungan RNA, translasi protein, dan transpor protein. Yang mengejutkan tim, Guttman mengatakan, sebanyak empat protein terikat secara khusus pada RNA nonkode struktural yang membentuk mesin sel yang bertugas mengoordinasikan proses tersebut.
“Protein virus NSP16, misalnya, terikat ke urutan RNA inang dalam spliceosom sedemikian rupa sehingga kompleks tidak dapat mengenali transkrip RNA, apalagi menyambungnya dengan benar. Protein virus NSP1 terikat ke ribosom dalam posisi yang membuat mRNA tidak mungkin masuk – pada dasarnya “meletakkan gabus” dalam struktur penerjemah protein, kata Guttman. Protein virus NSP8 dan NSP9 terikat dan mengganggu partikel pengenal sinyal, sebuah struktur yang membantu mengangkut protein yang baru diterjemahkan ke sekitar sel.
Berdasarkan hasil ini, tim memperkirakan bahwa infeksi SARS-CoV-2 akan secara drastis mengurangi penyambungan, translasi, dan transportasi protein dalam sel manusia dan akibatnya akan menekan respons interferon, yang bergantung pada peningkatan ketiga proses ini. Memang, sel epitel paru-paru yang terinfeksi virus menunjukkan hal itu, para peneliti melaporkan dalam makalah mereka.
Christian Münch, ahli biologi sel di Goethe University Frankfurt yang tidak terlibat dalam penelitian ini, memuji deskripsi komprehensif studi tersebut tentang mekanisme biologis dasar yang mendasari efek ini.
“Ini adalah salah satu contoh bagus di mana metode yang sangat bagus [diterapkan pada] virus baru ini untuk melihat apa yang sebenarnya terjadi di dalam sel setelah infeksi,” katanya.
Seperti yang dicatat para peneliti dalam makalah mereka, Münch menambahkan, penelitian tersebut tidak mengesampingkan peran jalur lain dalam membantu SARS-CoV-2 menghindari pertahanan tubuh atau memeriksa interaksi potensial di antara protein virus itu sendiri. Dia menambahkan bahwa pekerjaan di masa depan dapat melihat lebih jauh bagaimana efek berkembang dari waktu ke waktu dari infeksi.
Guttman mengatakan tim tertarik pada kemungkinan implikasi terapeutik dari hasil studi tersebut. Salah satu cara untuk menargetkan protein virus seperti NSP1 dengan obat yang menghentikannya berinteraksi dengan peralatan seluler.
“Kami ingin memahami bagaimana virus dapat mengganggu mesin sel inang, namun dapat menggunakan ribosom, dapat menggunakan mesin perdagangan – semua hal ini telah dimatikan,” jelas Majumdar.
Data awal menunjukkan bahwa loop berbeda dalam struktur mRNA SARS-CoV-2 dapat bertindak sebagai sinyal tersebut, kata Majumdar. Memukul putaran dengan obat molekul kecil dapat membantu memblokir aktivitas virus di dalam sel yang terinfeksi. (CNN/ms)
